因具体病因不同，疾病类型不同，患者临床表现有所差异，总体表现为甲状腺肿大、疼痛等局部症状和由甲状腺功能变化引起的甲亢、甲减等全身症状。
典型症状局部症状总体表现为甲状腺不同程度的肿大，触摸起来质地较硬，可能有程度不等的疼痛症状。
对于亚急性甲状腺炎患者来说，甲状腺区疼痛明显为其特征性表现。
对于功能正常的桥本甲状腺炎患者，可能有咽部不适、轻度吞咽困难或颈部压迫感。
全身症状甲状腺炎是甲状腺的肿胀或炎症，可导致甲状腺激素过度或不足。甲状腺炎有以下三个阶段:
甲状腺毒症期
甲状腺毒症期是指甲状腺发炎导致滤泡结构破坏或坏死，使储存于甲状腺滤泡腔的甲状腺激素漏出并进入血液。由于甲状腺功能呈亢进状态，表现为患者易烦躁、体重减轻、怕热、失眠、心动过速、乏力等。
甲减期
甲状腺激素过量释放几周或几个后，甲状腺不会释放出足够的甲状腺激素，导致缺乏甲状腺激素或甲状腺机能减退。患者会出现疲劳、水肿、体重增加、怕冷、便秘等症状。
恢复期
恢复期是指甲状腺从炎症中恢复并且能够维持正常激素水平。多数患者可恢复正常功能，少数为永久性甲减。
对于因桥本甲状腺炎导致甲减的患者，常常只存在甲状腺功能减退的表现，多数患者以甲状腺肿或甲减症状首次就诊。对于亚急性甲状腺炎、无痛性甲状腺炎患者，存在以上三个阶段的表现。
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