亚急性甲状腺炎诊治指南推荐初始泼尼松20-40mg/日，维持1-2周，缓慢减量，总疗程不少于6-8周。对于激素治疗停药指征，推荐摄碘率恢复正常后方可停用糖皮质激素，这比以血沉恢复正常为停药标准好，治愈率提高，复发率减少。
应用糖皮质激素后，若摄碘率持续降低，提示炎症反应继续，应延长使用糖皮质激素；停药或减量过程中反复者，仍可继续使用糖皮质激素。
中药在抗病毒方面具有一定的优势，清热解毒的中药治疗，如清开灵胶囊，双黄连口服液等。加用中药后能逐渐减少和停用激素治疗，不会出现单用激素减药后的反跳或复发现象。
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